O HIV-1 possui grande diversidade genetica, sendo classificado em grupos, subtipos e sub-subtipos. Estudos sugerem que o comprometimento clinico dos pacientes pode ocorrer de forma distinta dependendo do subtipo, sendo a quantificacao do RNA do HIV-1 uma ferramenta importante no monitoramento do tratamento antirretroviral e prognostico da infeccao. Sabendo-se que o HIV afeta diretamente o SNC, a quantificacao do RNA do HIV-1 no LCR pode ser util na avaliacao da resposta a terapia em pacientes com alteracao neurologica. O estudo objetivou quantificar o RNA do HIV-1 no plasma e LCR de pacientes infectados e correlacionar com caracteristicas genotipicas e imunologicas do HIV-1, coinfeccao com hepatite C e efetividade de penetracao no SNC dos antirretrovirais em uso. Realizou-se a quantificacao do RNA do HIV-1 no plasma e LCR de 68 pacientes: 38 genotipados em concentrado de leucocitos (env), 22 no plasma (pol) e 2 no LCR (pol). A padronizacao da genotipagem em amostras de concentrado de leucocitos e LCR e a quantificacao do RNA do HIV-1 no LCR foram realizadas com sucesso. Houve correlacao linear positiva entre a quantificacao do RNA do HIV-1 no plasma e no LCR."